北京生命科学研究黄牛实验室里峰值运算速度65万亿次秒浪潮天梭TS10000超级计算系统正运转该系统目前中国生命科学研究领域浮点力高峰组浪潮天梭高性系统英特尔45nm技术中国第次规模应堪称中国45纳米四核第单
记者查阅2007年国高性计算TOP100排名套浪潮天梭放该榜中峰值力完全排前30名例第23位中国石油公司超级计算机投建2007年计算力约6664万亿次秒套系统相差
整合Intel 45nm 创造生命科研高峰
北京生命科学研究作中国政府发展生命科学技术领域重战略布局成立cellNature等国际核心学术杂志发表文直居科研院首黄牛博士介绍说基高性计算机生物分子进行深入基础进行药物设计年国际生物医药研究前领域名字命名黄牛实验室研究方分子目前然界物质结构复杂分子生物分子环境组成系统包括万十万原子类研究需量数处理模型模拟高性计算系统性提出更高求
针北京生命科学研究应需求结合浪潮年生命科学应领域积累丰富验浪潮特应规划系统设计作深入调研分析精准方案部署提供针次项目需求基英特尔45纳米四核处理器浪潮天梭TS10000集群
1)该系统达102节点全部采Intel 45nm制程技术四核强处理器频高达20Hz整套系统204颗CPU816颗计算核心系统峰值计算性达6500Gflops(65万亿次)成中国生命科研领域峰值力强高性系统满足户高性计算力求
外套浪潮天梭高性计算系统功耗远低业界类产品领先45nm技术配合浪潮独系统优化技术系统计算性获超20%提升时功耗节省30年节电数万千瓦时
2)套千兆计算网络兼理网络针户应特点采3台48口千兆交换机堆叠提供1000Mbps通信满足IO请求带宽延迟需求
3)集群中部署OpenPBS作业调度系统提高规模作业理高效性便捷性浪潮TSMM20监控理软件实现整套系统单映射系统理员提供监控理集群中节点统台
系统拓扑图
天时 科研效率提速
利计算机进行药物筛选针治疗疾病靶标——生物分子(酶蛋白质受体核酸)筛选化学分子库堆钥匙中选出匹配钥匙开特定锁样生物分子钥匙药物分子锁选择合适生物分子开药物分子锁药物研究中锁钥匙原理
黄牛博士介绍研究程中效利获生物学信息针疾病靶标设计治疗性药物需原子水掌握生物分子三维结构生物功间关系生物分子环境组成系统包括万十万原子数库里面实现钥匙配锁项十分复杂困难工作样研究没高性计算机根进行
编辑点评:
浪潮天梭采Intel 45纳米处理器筛选效率提高十甚百倍例利单CPU工作站生物分子进行20万分子库筛选需10天采Intel 45纳米浪潮天梭超级计算机仅仅半时提高工作效率
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